UPT/Laboratorium Perikanan Air Payau dan Laut Probolinggo memiliki fasilitas bangunan di atas lahan seluas 1.005 m2 terletak di Jl. Hayam Wuruk No. 66, Kelurahan Mangunharjo, Kota Probolinggo, Propinsi Jawa Timur, yang meliputi :

1.  Gedung A terdiri dari:
1. 1 Lantai 1 Ruang Seminar seluas 52,62 m2
1. 2 Lantai 2 Ruang Tidur seluas 54,62 m2

2.  Gedung B Asrama, terdiri dari:
2. 1 Ruang Kuliah seluas 43,65 m2
2. 2 Ruang Dosen seluas 31,60 m2
2. 3 Kamar Tidur seluas 45,75 m2
2. 4 Ruang Tamu seluas 31,50 m2
2. 5 Hall seluas 10,80 m2
2. 6 Gudang seluas 12,25 m2
2. 7 Mushollah 5,00 m2
2. 8 Kamar Mandi/WC seluas 14,50 m2

3.  Gedung C , terdiri dari:
3. 1 Kantor I dan II masing-masing seluas 26 m2
3. 2 Laboratorium seluas 52 m2
3. 3 Ruang administrasi 16,25 m2

4.  Laboratorium Pembenihan seluas 158,07 m2 , yang terdiri dari:
4. 1 Selasar seluas 113,143 m2
4. 2 Bak Pembenihan seluas 44,64, yang terdiri dari:
4. 2.1 Bak pembenihan 1 dan 2 masing-masing seluas 12,00 m2
4. 2.2 Bak pembenihan 3 dan 4 masing-masing seluas 7,50 m2
4. 2.3 Bak pembenihan 5, 6, 7 masing-masing seluas 1,41 m2